北京大學深圳醫(yī)院坐落在深圳美麗的蓮花山畔，是深圳市政府投資建成的集醫(yī)療、教學、科研、預防和保健為一體的現(xiàn)代化三級甲等綜合性公立醫(yī)院。醫(yī)院于1999年底建成開業(yè)，2001年3月醫(yī)院正式更名為“北京大學深圳醫(yī)院”和“北京大學深圳臨床醫(yī)學院”，成為北京大學非直屬附屬醫(yī)院。2011年被評為三級甲等醫(yī)院，2017年通過三級甲等醫(yī)院復審，同時成為廣東省“智慧醫(yī)院建設單位”。

2018年12月，成為建立健全現(xiàn)代醫(yī)院管理制度國家試點醫(yī)院。2019年通過國家電子病歷系統(tǒng)應用水平分級評價六級。醫(yī)院醫(yī)療質(zhì)量連續(xù)14年在深圳排名第一或A級，在2018屆粵港澳大灣區(qū)最佳醫(yī)院50強位居32。2019年7月，醫(yī)院入選廣東省高水平醫(yī)院建設單位。 

醫(yī)院占地面積5.9萬平方米，總建筑面積21.2萬平方米，編制病床1600張，開放床位1723張，醫(yī)院現(xiàn)有工作人員3000余名，其中高級職稱人員763名，碩博研究生742名，占醫(yī)技人員總數(shù)30%以上，擁有各級高層次人才43人。醫(yī)院開設55個臨床醫(yī)技科室，年門急診量約300萬人次，年出院病人約8.0萬人次，年手術(shù)量約5.6萬臺次。